Выпускница Сибирского государственного медицинского университета по специальности «педиатрия», квалификация — «врач-педиатр» (дата окончания вуза — 26 июня 1993 года). В 1994 получила удостоверение о прохождении интернатуры в СибГМУ, квалификация «врач-инфекционист». В 2004 Лена Саакян повысила на базе СибГМУ квалификацию, получив свидетельство по специальности «дерматовенерология» и соответствующий сертификат.
В 2007 году Лена Валикоевна прошла обучение в Новокузнецком ГИУВе, получив свидетельство о повышении квалификации по направлению «Врачебная косметология: теория и практика». Затем на базе Центра образовательных услуг «Бьюти Форум» получила удостоверение «Мезотерапия в терапевтической косметологии» от 27 октября 2008 года, а 9 декабря 2008 года получила в том же центре удостоверение по инъекционным методикам в косметологии. В 2009 Лена Саакян продолжила совершенствовать профессиональное мастерство в СибГМУ, получив свидетельство о повышении квалификации по специальности «дерматовенерология». 24 декабря 2012 года в Алтайском государственном медицинском университете ей были выданы диплом и сертификат о профессиональной переподготовке по специальности «косметология». А 22 ноября 2014 года Лена Валикоевна продлила в ГОУ ВПО СИБГМУ Росздрава сертификат и удостоверение по специальности «дерматовенерология» сроком действия на 5 лет.
